但为什么如此讲义气、又有着不世之功的两位名将为排名垫底呢？其实这是李世民心中打的一个小算盘。因为李世民是皇帝，是天子，所以他必须摆出一个姿态，在表彰功臣的同时也要搞一个平衡，他不能太偏心自己所喜欢的人，这让那些与李世民关系不那么好的功臣能够心理平衡，感觉唐太宗大度、不会偏私，所以秦琼与李勣被排在凌烟阁的尾部也是情有可原。
不仅如此，李世民在排列站位的时候还要考虑这些功臣的立场问题。在排名中可以看出，长孙无忌、尉迟恭、侯君集这类排在凌烟阁前列的人都是跟随他参与到玄武门之变中的。而李勣和秦琼并没有参与，对于他们来说，因为李世民发动政变、杀死亲兄弟是违反道义的，最讲究情意的他们绝对不会参与到玄武门之变中，这是他们被李世民放在二十四功臣末尾的最重要的因素。
虽然他俩垫底，但不代表李世民不喜欢他们，因为他们死后都是陪葬昭陵的，昭陵可是皇陵，让秦琼与李勣死后葬入皇陵，可以说是李世民在另一方面的补偿吧。
