郑成功的坚决反对，使得朱以海放弃了挣扎。
朱以海占据舟山以后，已经在组建新的政府机构，也联络上了不少明朝旧臣。可就在这个档口，清军已经朝着舟山杀了过来。
张名振不得已只好带着朱以海前往厦门，希望郑成功能够支持朱以海。郑成功跟朱以海是有仇恨的，当年朱以海和隆武帝之间有过很大的矛盾，甚至爆发过战争，所以郑成功至今都不支持朱以海称帝。
朱以海知道，郑成功若不支持，那么他这一支的抗清力量就算是彻底完了。所以他也就放弃了挣扎，表示自去监国封号，这才得到了郑成功的收留，居住在了金门。
此后东南沿海的抗清力量，主要就是以郑成功为主了。朱以海失去了相应的号召力。一直等到1661年，吴三桂杀掉永历帝朱由榔以后，张煌言还希望朱以海出山主持大局。这个时候郑成功依旧表示不支持，虽然养着朱以海，但是不到万不得已，绝对不会让朱以海出来做皇帝。仅仅隔了一年，朱以海便带着无限的遗憾，离开了人世。
