公元前68年,霍光病逝,汉宣帝和上官凤儿一同到场治丧,以皇帝级别将霍光陪葬于汉武帝茂陵。但说来也是讽刺,霍光生前位高权重,但并没有做出谋反的事情,除了废掉刘贺这位皇帝,其他倒也没有什么可说的了,更何况"昭宣中兴"也是有霍光的一份功劳。
然而霍光离世两年后,霍家反了,霍家一族因此被满门抄斩,霍成君也被废处昭台宫,公元前54年,霍成君于云林馆自杀,自此上官凤儿再无一个亲人。
不过无论是父系诛杀,还是母系被诛杀,都没有牵连到上官凤儿的身上,公元前37年,52岁的上官凤儿寿终正寝,与汉昭帝合葬在平陵。