圆明园的大火烧了3天之久，导致300多太监宫女葬身火海，20多名太监力战不敌以身殉职，总管圆明园的汉族大臣文丰投湖自尽。在那场大火中，无数中国的国宝悉数遭到了焚毁，其中以古籍的损失最为严重，有上万卷珍贵图书灰飞烟灭。英法联军干下了人类历史上最为罪恶滔天的罪行之一。
到了同治年间，西太后多次试着要去重建此园，但是开工9个多月后却因资金不足而停工。到了光绪22年，慈禧再次修缮了圆明园中的双鹤斋和課农轩等，虽然属于小修小补，但也为圆明园留下了一些东西。
庚子年也就是1900年，八国联军再次来袭，慈禧光绪仓皇西去，京师陷入一片混乱，很多地痞流氓和八旗兵勇趁机而动，多次洗劫圆明园，不仅让之前的修缮工作毁于一旦，而且还毁掉了园中所有的古树名木。
到了北洋期间，权贵们继续从破败的圆明园里榨取油水，他们将园中仅剩的石雕，太湖石等搬运到自家院子作为装饰。当时的北京巡阅使，后来的总统曹锟，"马桶将军"京畿卫戍司令王怀庆，步军统领聂维城，甚至京兆尹刘梦庚都做过这样的事情。尤其是那个聂维城，他的父亲聂士成当年因抗击八国联军而闻名。
此后，凡是驻扎在西苑一带的军队，比如宋哲元的29军，东北军的53军，都拆除售卖过圆明园的砖石，甚至施工中的颐和园，燕京大学，北平图书馆都曾先后从这里运走石料，圆明园俨然成了一个石料厂。
