满族女真的军事实力增强后，便开始大举进攻明朝疆土，意图入主中原，建立大一统王朝。而随着女真政权与明政府之间的战争爆发。
江河日下、日渐衰微的明政府碰上实力强劲的满族人，自然是节节败退，满族女真政权一路攻占了许多地区，这些地区中的百姓有蒙古人也也有汉人，原有的八旗制度不适用于给这些民族的人划分等级，也不方便治理他们。
于是，统治者在现实条件的逼迫下又适当调整发展了八旗制度。努尔哈赤在天命年间最早设立蒙古旗，将蒙古人也纳入八旗制度中，将蒙古人置于女真人的统治之下。到了公元1635年皇太极编成了蒙古八旗。
汉族是中原地区人民的主体，满族人想要入主中原，那么就要管理好汉人，公元1631年皇太极先编制了一汉军旗，到了1642年才最终完成汉军八旗的编制。满族八旗、蒙古八旗和汉人八旗一起合称为八旗，皇帝作为统治者统率八旗满洲贵族、八旗蒙古人和八旗汉人，到这里八旗制度得到了完善。
