对于晚晴大太监李莲英死因的研究，源于他的墓葬发现。李莲英的坟墓占地有20亩，在北京恩济太监坟地之中，外表看起来十分豪华，在太监墓之中特别扎眼。李莲英的墓葬完全可以和清朝的一些王侯将相的墓相比，那么里面是什么样子的呢？
1966年，考古学家对李莲英的墓葬进行了挖掘，挖掘工作进行了一周，才最终找到了入口。李莲英的墓葬规格是典型的金井玉葬，在当时来说规格极高。陪葬品甚多，一共有五十多件，都是金银珠宝。其中有一件非常珍贵的无价之宝，一个钻石帽饰，上面的珍珠比英国女王所戴的还要大，可见李莲英在生前极为富有，不知受到慈禧的多少赏赐。
当时的考古学家只注意到李莲英的棺材之中躺着的是一个人形，而且还盖着被子。在处理完周边的陪葬品之后，他们抖开了李莲英身上的盖着的长袍，随后他们竟然发现，李莲英的尸体只剩下了一个头颅。这个头颅并未是骷髅状的，还连着皮，应该是割下来放在棺材里下葬的。而刚开始考古学家们看到的那些手脚只不过是有人为了给李莲英造一个全尸，在衣服里面塞上了棉花而已。
李莲英的坟墓在一座学校旁边，他的头骨被憎恶他的学生们当做皮球一样四处踢，最后扔在了粪坑里。后来被考察李莲英墓葬的考古学家捞了上来，重新找到一处地方安葬了。
