但皇帝很忙，大仗不打，小仗还是不少的。而战果达三位数的一仗，发生在顺治十五年六月，宁古塔都统率战舰40艘在松花江下游和俄国人遭遇，一举歼敌270人。至于其他几次遭遇，则打死十几或是几十而已。
直到三藩之乱都搞定，1682年，康熙帝便赴关东东巡，了解黑龙江的情况，他先是派小分队打着捕鹿的旗号，来到雅克萨附近勘探地形，又不许蒙古人与俄国人做买卖，而后在瑷珲这个地方修筑了一座城，以此为据点，慢慢形成对雅克萨的攻击之势。
1683年，清军便正式勒令沙俄从雅克萨滚蛋。但俄国人反而派兵来打瑷珲，被击败。
真正的战事，发生在1685 年，清军约三千人开始围攻雅克萨，城中的俄国人仅有450人而已，火力也远不如清军。但清军仍未将其全歼，而是纵敌逃走，这是第一大错。拿下雅克萨之后，不是留下军队驻守，而是毁城班师，这是第二大错。
