在收复台湾的时候，纳兰明珠也做出过很多的贡献，当时台湾由于受到大陆迁界禁海政策的影响，岛上居民的生存面临很大的危机，于是便请求能和朝廷和解。在台湾的官员中有一位郑泰的官员，他是正经的叔叔，他暗地里想和纳兰明珠共同反对郑经的统治，纳兰明珠便轻信了他的言语，结果被郑经所识破。信南侯郑泰被郑经处决，纳兰明珠也陷入一个危机，但是纳兰明珠勇敢不惧，成功的把施琅拉拢到清朝的这一边，加深了台湾官员之间的不信任，为后来收复台湾打下了重要基础。
但是就是这样一位出色的大臣，因为一次失误，铸成了千古之恨。纳兰明珠和康熙皇帝不仅是君臣关系，同时，纳兰明珠的妹妹，更是康熙皇帝的妃子。可以说，纳兰明珠的地位是非常显赫的，但是在康熙皇帝的后期，纳兰明珠掺扯进了党争问题，他在暗地里帮助大阿哥与太子抢夺皇位，可以说，这一点让康熙皇帝非常生气。因为，康熙皇帝最见不得不忠诚和兄弟残杀，这大大的损害了他在康熙皇帝心目中的形象，最后，康熙皇帝给了他一个非常残酷的处决办法，贬为庶民永不录用。
