除了预言窦武下场的奇事，卢植在后来黄巾叛乱之时也是全力剿匪，并且立下大功，可是这样一位人才，却是恰逢乱世。在董卓乱政时，卢植依旧身居朝中，面对这样的乱象，大多臣子只能禁言。
可卢植却是坚守心中的正义，丝毫不畏死继续上书进言。这样的大胆上谏多次险些惹恼董卓。之后董卓想要废帝自立，卢植依旧上书怒斥，董卓虽然不敢明面杀他，但也废了他的官位，将其赶回老家了事。
在躲过了董卓的暗杀队伍之后，卢植对朝廷彻底丧失了信心，但是过去学习的经书让他没有办法昧着良心追随曹操这些人。所以他隐居军都山，在这里度过余生。袁绍曹操等人多次请其出山，最后却是无功而返。
