元顺帝北逃后，其元朝皇帝的名号尚存。他死后，其子爱猷识理达剌称帝于塞外。他死后，他的儿子脱古思帖木儿继位，在洪武二十二年（1389年）被部下也速迭儿所杀，蒙古诸部自此秩序大乱，一些重要的首领则相继归附明朝。而明朝建文四年（1402年），鞑靼部帅鬼力赤杀害北元第七任汗坤帖木儿，去掉国号大元，自称鞑靼。"有鬼力赤者篡立，称可汗，去国号，遂称鞑靼云。"而在达力扎布的《北元史研究三题》中说鬼力赤没有去国号，而是在此以后不复知帝号，元的国号一直存在，只不过酋长们身边已经没有能起汉式年号的汉臣了。
明太祖洪武末年到永乐初年，蒙古诸部分裂成三部：一个是兀良哈部，地处于西辽河、老哈河一带；鞑靼部地处鄂嫩河、克鲁伦河和贝加尔湖以南地区；瓦剌部位于科布多河、额尔齐斯河流域和准葛尔盆地。
鞑靼在土木之变的时候已经衰弱不堪了。
明成祖继位对蒙古进行了五次北征，这五次北征对鞑靼部打击构成了不小的打击，而瓦剌在鞑靼部势力消减的时候，数次进攻鞑靼首领阿鲁台。宣德元年（1426年），阿鲁台在瓦剌部首领脱欢的打击下，人畜丧失殆尽，遂投靠兀良哈部，最后仍被脱欢杀死。
