原因其实很简单，为了维护自己的统治地位，如果朱元璋仅仅是想要推翻大元朝的政权，那么肯定是不喜欢忽必烈这位皇帝的，但是朱元璋现在想的可是江山社稷，如果自己有什么缺陷，可以向忽必烈学习。从朱元璋上位以后，就表示过，一律不准说元朝不好，对于元朝的忽必烈，曾经的皇帝一定是尊敬的。所以明朝的帝王庙中一直有忽必烈的雕像。
到了明朝嘉靖皇帝，别看这位嘉靖皇帝非常喜欢帝王之术，但是对于忽必烈，在开始的评价却是非常好的，因为总有大臣来上奏，说明朝的皇帝建造的帝王庙里面，应该移除元朝的雕像，但是嘉靖想了想，这个话是不对的，为什么要供奉三皇五帝，以及汉武帝，唐太宗，都是前朝的皇帝呀，所以忽必烈既然明太祖要把他放在这里，想必是非常有用意的，如果只是一味的用私人恩怨来说，并没有什么实际的学习意义。
明朝的统治者这算是承认了蒙古的先人们做的成就，但是蒙古族的心思还是要在马背上争夺天下，他们虽然在元朝末年的时候被打趴下了，但是还是有卷土重来的勇气的，也符合游牧民族对于征战的意义，他们就是这样输了也不会没有斗志的民族。重新骚扰明朝的边境，气的嘉靖把忽必烈等人的塑像全部砸了，明朝的帝王庙里面也没有了元朝的皇帝。
