没过多久，由于离开家的时间太长，华佗想回去。多疑的曹操就派人过去他家，结果发现他的妻子并没有病，于是他命人把华佗抓回了宫。华佗的撒谎，曹操很生气，关键是华佗还不知悔改和认错，他总是养成良好的生活习惯，否则靠他是治不好病的。两人因为观念不同，本来就有陈见了，曹操怒不可遏，最终把华佗处死了。
据史料记载，就在华佗要被处死的时候，荀彧曾经替他求过情。而曹操是这样回答的：“佗能愈此。小人养吾病，欲以自重。”大意就是，华佗本能治好我的病，却故意拖延，想要借此提高自己的地位，谋得一官半职。曹操讨厌华佗的这种行为，最终才杀了他。由此可见，华佗的医术虽高，但情商却很低。也正是因为如此，他才在这场三国时期的“医闹事件”中，付出了生命的代价。
而华佗死了，曹操的头痛之症再无人能医治了，他事后显然也是后悔的，只是，这个世上没有后悔药可吃。
