不久，白齐文就跑到了苏州投奔太平天国慕王谭绍光。在苏州期间，谭绍光非常擅长与文琪对话。他想要权力和金钱。但是在这个时候，权力和金钱不再能满足白齐文。他清楚地看到太平军的形势不是很好，又想着投降洋枪队统领戈登。
后来，白齐文向谭绍光要了2000人，但最后他给了他1000人。白齐文认为这个人不能发挥他的才能。不久，白齐文向戈登投降了。为了阻止白齐文，美国领事遣送他到日本休养了，并禁止他返回中国。然而，爱财如命的白齐文，还是回到中国继续赚钱。那时这时候清廷是不会再用他了谁能料到白齐文跑去投靠福建漳州的太平天国侍王李世贤，刚到福建的白齐文就被清廷抓住了。
当时，清政府官员认为白齐文是一个两面派，忘恩负义的人。留住他毕竟是一个祸害，但因为他是美国人，他不能未经授权就杀了他。李鸿章下令将白齐文押送至苏州监狱，但是暗地里却将白齐文淹死在浙江兰溪，对外宣称他是意外溺毙。本来，白齐文可以度过余生，但他喜欢死，最终死在李鸿章的手里，在内心深处。事件发生后，美国领事没有证据，不得不放弃此事。
