后来西汉王朝没落后，中原群雄争霸，和楼兰国联系便少了，以至于后来断了联系，后来人们再次到达楼兰国时，这里已经是寸草不生，早已没有楼兰国，楼兰为什么不再了，就成为了一个谜团。
楼兰国之所以消失，现在原因还不是不确定，不过大致的说法有几种。第一种说法是，因为楼兰国发生瘟疫，死了很多人，剩下的便迁徙到别的地方，有人说迁徙到了米兰，不过由于没有太多资料考察，真实性无法判断。
第二种说法是，楼兰被别的国家灭亡了，并且屠城，由于楼兰国没有太多资源，侵略并没有留下了，楼兰国也就这样消失了。只所以这样说，是因为有史料记载，楼兰国曾被匈奴、吐蕃等国统治。
