汉武帝还有一个错误就是误打压了卫青。我们都知道，卫青的姐姐卫子夫是汉武帝的皇后，而卫青也是汉朝的大将军。而汉武帝害怕卫氏家族功高盖主会不忠于朝廷。汉武帝为了避免由外戚掌权的场面，到了晚期以一些莫须有的罪名不再重用卫青了。虽然卫青是那种不重视功名利禄的人，对于这一切都不在意。但是这对卫青来说很不公平，他为汉朝开拓疆土做出重大的贡献，也没有反叛的心，可是还是被汉武帝疏远了，令人心寒。
汉武帝到了晚年，十分的迷信。迷信的汉武帝在晚年犯了一个很大的错误，就是他错信了朱世安。这一个错误牵连了很多人，几万人由此丧命，甚至连皇后和太子都被汉武帝给杀了。这就是著名的"巫盅之祸"。朱世安原本是京城里面的通缉犯，公孙贺为了救自己的儿子，就把朱世安抓来献给了汉武帝，借此抵消自己而已犯下的错误。可是，朱世安被捉之后，上书给汉武帝称公孙贺的儿子利用巫盅也就是埋下小偶人来诅咒汉武帝。汉武帝就命令了江充彻查此事。
而江充却借此机会祸害太子，他准备了很多小偶人趁乱埋进了皇后和太子的宫殿，再把它们挖出来，作为证据交给了汉武帝。被江充陷害的太子在情急之下杀死了江充，正准备向汉武帝解释的太子，却又被人告密说太子要造反。于是汉武帝派使者下去询问太子谋反这件事。可是这个使者并没有去找太子，而是在汉武帝面前撒谎称自己险些就要被太子杀掉。听到这一切的汉武帝龙颜大怒，派兵去解决太子谋反的问题。太子自然也召集了自己的军队，汉武帝的军队和太子的军队战了几天，最后还是太子战败。这一场战争不仅死了了数万官兵，而且太子的儿子被杀了，陪伴汉武帝多年的皇后卫子夫也因此自杀死了。这一场关于巫术的混乱牵连了后宫很多妃嫔以及很多官员，被牵连到的人都被杀了。而汉武帝清醒过来之后，后悔自己杀掉了太子却已经无法挽回了。
