九门提督负责京师的警卫、治安，其统率的部队长期保持在3万人左右，人数虽然不算很多，但由于其职能太过重要，因此不仅人员精干，而且装备极为精良。而步军统领衙门除衙门本部外，还下设八旗步军营、巡捕五营、内外城十六门管理机构和白塔山信炮管理部门。
从设立过程来看，"提督九门步军巡捕五营统领衙门"其实是几个衙门合并之后产生的部门。步军统领最早设立于清初，主要是统辖八旗步兵营的一个官职，是个纯粹的武将官职。而提督九门事务的职责，最早则隶属于兵部管辖。
康熙十三年（1674年），提督京城九门事务被从兵部分割了出来，开始由步军统领兼任，品秩为正二品。
康熙三十三年（1691年），步军统领除了提督九门事务之外，又开始监管巡捕三营事务，官衔也随之被改为"提督九门步军巡捕三营统领"。
