黄文金守卫了湖口三年，这其中他不仅把湖口守卫得固若金汤，还屡次配合周边地区的太平军打击清军，战功赫赫。一直到1857年，清军大举入侵，九江地区大势已去的时候，湖口才失守，1859年，韦俊反叛的时候，黄文金力挽狂澜，反击韦俊，夺回了池州城，极大的减小了韦俊反叛的负面影响。
1860年，清军在江南卷土重来，再度围困天京，李秀成想以围魏救赵之计救援，黄文金和东王杨秀清之弟杨辅清血战天京西南，为李秀成第二次打破江南大营创造了有利条件，之后黄文金转战东南战场，1861年5月30日，黄文金和谭绍光攻破浙江湖州城，当年黄文金被封为堵王。
之后黄文金便一直镇守着湖州，他不仅屡次击退清军，还将湖州治理地井井有条，1864年4月，左宗棠横扫浙江后，湖州之战成为浙江最后一场血战，黄文金背水一战，不仅杀伤清军近万人，就连洋枪队都被他大败。1864年，天京陷落后，他竟然还迎幼天王洪天贵福至湖州，本想在湖州重振河山，但他详细分析后，认为湖州是一座孤城，陷落只是时间问题，于是决定突围，转战江西。他的本意是想和侍王李世贤军同去湖北会合扶王陈德才大军会和，再图大业。
可惜，刚刚离开湖州，他就在就在宁国墩猝亡（病死），而这一支太平军，也因丧失统帅而在石城之战中全军覆没。
