1949年，英宗被俘后，明朝对瓦刺不敢再轻敌，同时吩咐大同边将，瓦刺再来，不可轻易与战。同年代宗即位，十月初的时候，也先挟持英宗大举进犯，志在必得。他们迅速越过长城，抵达大同，代宗惊慌之下召集各诸侯王来京救援。很快，也先的军队攻破紫荆关，继续向京师进发，代宗宣布京师戒严。同时，调宣府镇朔将军、辽东征虏前将军迅速带兵入京。代宗仍然对前景充满担忧，便令山东、河南、山西、陕西的巡抚各自招募义兵，来京增援。十月下旬也先军队抵达京城。这场京师保卫战以都督高礼与毛福寿在彰义门挫败也先前头部队的进攻拉开序幕。代宗接到捷报后，派王复、赵荣与也先谈判，但是也先要求太高，因此谈判失败。代宗又急调河洲的卫士军，另外派使者向朝鲜借兵。这个时候代宗做出了一个很英明的决定，就是重用大将于谦，民族英雄于谦忠心义烈，有胆有谋，他带领二十万兵马、几天内接连打了几次胜仗，也先接连后退，被逼退出紫荆关。十月末，瓦刺可汗脱脱不花派使者前来议和，十一月也先率兵退回瓦刺。
1950年2月，不甘心失败的也先再次从宁夏对明朝进行侵略。被总兵郭登在沙窝打败，并追击至栲栳山（今河北与内蒙交界处）。同年，景帝任命石亨为镇朔大将军率师巡大同，杨能为游击将军、巡宣府。3月份瓦刺分别进攻朔州，宁夏、庆阳、均被击退。4月份，瓦刺再次侵略大同、雁门，被击退。同时景帝任命刘安为总兵官，在保定、真定、涿州、易州、通州等地训练士兵，以备瓦刺。5月份接连失败的瓦刺派使者前来议和，但态度傲慢，并以英宗进行要挟，由于要求苛刻，被景帝拒绝。6月份，瓦刺也先再次挟持英宗大举进攻大同、宣府，但分别被郭登、朱谦击退。之后，景帝派遣使者李实、罗琦出使瓦刺，并议和。很快又派遣杨善、赵荣再次出使瓦刺，迎回了英宗。
1951年也先杀死脱脱不花，自立为可汗。同年瓦刺对明朝俯首称臣，再次开始了的对明廷的进贡，这场战争以瓦刺的失败告终。
