首先，历史上只记载了上官婉儿嫁给唐中宗，期间与武三思私通，同时还和武则天的男宠闹过绯闻。而在墓志铭中的记载，上官婉儿嫁过两任皇帝，一是在唐高宗时期，武则天加封婉儿为才人。加封才人，是因为武则天对上官婉儿的赏识和提拔，借此让婉儿摆脱贱籍。
专家指出，上官婉儿与唐高宗并无夫妻之实，因为那时的高宗已是晚年，病体沉重到无法处理朝政，哪有心思去临幸一个13岁的少女。再者，因为唐朝后宫女官的最高品级是尚宫，但以宫妃品级起步的话，最高可以到一品，可见武则天对于培养上官婉儿是寄予很高的期望。上官婉儿在武则天时期就开始掌管制诰，参决政务，虽无丞相之名，却有丞相之实，所以后世人称"巾帼宰相"。
公元705年，太子李显与大臣在洛阳紫微城发动兵变，逼迫女皇武则天退位，武则天下台后，身为武则天心腹的上官婉儿为什么会不罚反奖？因为在这场神龙政变中，上官婉儿是协助兵变逼宫的内应。唐中宗上位后很感激她，令她专职起草诏令，并册封她为正二品昭容。这时的婉儿权势已达顶峰，但中宗册封婉儿为昭容，更看重她的政治实力，这对夫妻应该也是有名无实。
历史上记载的上官婉儿是韦后的左膀右臂，而在墓志铭中记载，上官婉儿是李唐阵营的。韦后欲效仿则天女皇，要唐中宗立安乐公主为皇太女做接班人。上官婉儿为了阻止这件事情，先是泣血死谏，接着自请退位，然后又要削发为尼，最后饮鸩求死，终于让唐中宗收回了成命。
公元710年，李隆基发动唐隆政变，上官婉儿和韦皇后，安乐公主一道被诛杀，上官婉儿不是站李唐阵营吗？怎么被自己人杀了呢？专家给出的解释是，在这场政变之前，李隆基已经筹划好与他的姑姑太平公主，以后免不了一场斗争，一个太平公主已经很难对付，再加上与太平公主关系密切的上官婉儿，两个女人加一起就更加难对付了，所以一不做二不休，在太平公主不在场时，趁乱诛杀上官婉儿。还有的史学家分析，李隆基有着正统的政治立场，反感女人当权，上官婉儿正是女人当权的符号，唯有把她杀了，才能消除女人当权的阴影。
