朱元璋晚年的大清洗行为，特别是蓝玉造反案大肆屠杀的几万人，本质原因还是为自己的宝贝孙子朱允炆披荆斩棘，加上沈家牵扯到蓝玉案之中，朱元璋下定决心斩草除根，不想给孙子留下一死隐患。有人说是因为沈万三总是在朱元璋面前炫富，引得仇富的朱元璋不满，这种说法还是有待商榷的。
明史之中记载，沈万三对南京城的建设是有不可磨灭的大功劳的。他出资修建了三分之一的首都，可以说是花费了巨资去讨朱元璋欢心。朱元璋出身贫苦，对富人有着天生的敏感和鄙视，明史之中记载了一段他和沈万三的对话：
他问沈万三，朕有百万军队，你能全部接济吗？沈万三说：我能给每一个军人犒赏一两黄金。沈万三一开口就许诺了朱元璋百万两黄金，朱元璋根本摸不透他到底有多少钱，不悦道：这是你的诚意，但是朕不需要了。
