马氏成为皇后之后，也不改纯良本性，丝毫没有沾染勾心斗角的气息。后宫的嫔妃被朱元璋宠幸后怀孕的，马皇后都很厚待她们，而一些古装电视剧中，后宫女子为了争宠，则经常使用堕胎等下三滥的手段。然而，朱元璋在成为皇帝后，却变得残酷暴戾。因此马皇后经常在身边提醒他要收敛性情，不要盲目给他人定罪。当时学士宋濂因为孙慎的事情受到牵连，被定为死罪，马皇后知道后劝说朱元璋，宋濂实诚忠厚，不知道实情，不应该受罚，但是朱元璋并不听从。恰好此时马皇后侍奉皇帝吃饭，但是马皇后却不吃酒肉，朱元璋询问其中的缘由，马皇后才说她是为宋先生在做福。听到这里，朱元璋很伤感，于是，第二天就赦了宋濂的死罪。
后来，马皇后重病卧床，知道自己已病入膏肓了，为了避免朱元璋迁怒御医，所以一直不愿意治疗。直到去世前，她依然不放心朱元璋，谓之曰：希望陛下能够任用贤人，听取谏言，从一而终，保持谨慎。子孙都是贤能之人，大臣百姓能够有所成就罢了。马皇后去世之后，朱元璋伤心不已，从此不再立后，因为身边少了一个可以规劝自己的人，所以朱元璋变得更加暴虐了。
