绍兴二十五年（1155年）十月二十一日，高宗去秦桧家探视病情，秦桧无一语，只流泪而已。当晚，秦桧去世，终年六十六岁，追赠申王，谥号"忠献"。
是月乙未，帝幸桧第问疾，桧无一语，惟流涕而已。熺奏请代居相位者，帝曰："此事卿不当与。"帝遂命权直学士院沈虚中草桧父子致仕制。熺犹遣其子埙与林一飞、郑柟夜见台谏徐喜、张扶谋奏请己为相。丙申，诏桧加封建康郡王，熺进少师，皆致仕，埙、堪并提举江州太平兴国宫。是夜，桧卒，年六十六。后赠申王，谥忠献。
开禧二年（1206年），宋宁宗下诏韩侂胄出兵北伐，四月，追夺秦桧王爵，改谥谬丑。
嘉定元年（1208年），史弥远掌权，积极奉行降金乞和政策，又恢复了秦桧的申王爵位及忠献谥号。
秦桧此人一生争议极大，到底是"忠献"还是"谬丑"？在主和之人眼中，他是"忠献"的，在主战之人眼中，他是"谬丑"的。在胡适的眼中，秦桧是这样的："秦桧有大功而世人唾骂他至于今日，真是冤枉。"，在《石匮书后集·卷第十一·袁崇焕列传》中也有这样的记载"呜呼！秦桧力主和议，缓宋亡且二百余载。"而史学家朱熹的言辞却另有一番景象，他说："秦桧之罪所以上通于天，万死而不足以赎买。"听罢此言，让人不禁扼腕叹息！
