明朝末年，中国的开放程度已经相当可观，甚至比清朝末年还要开放，当时西方很多传教士到中国来进行传教，天主教在中国也有了一定的市场，尤其在那些达官贵人之中，天主教也取得了不俗的成绩。乃至于南明朝廷危难之际能想到找远在欧洲的罗马教皇求助，结果当然是没用的。
南明的三位皇帝都或多或少、或深或浅的与传教士产生了关系。
弘光帝的父亲福王朱常洵结识了在开封传教的意大利人毕方济，二人关系十分友善，后来弘光帝在南京登基后召毕方济前来相助，如今罗马耶稣会还藏有弘光帝给毕方济的敕书。顺治二年（1645年）毕方济受命前往澳门求葡萄牙出兵相助，结果才走到半路弘光政权就被清军消灭了。隆武帝也与毕方济相识，二人相识很早。崇祯九年，还是唐王的隆武帝因私自掌兵而被投入凤阳监狱，毕方济曾为隆武帝鸣冤。顺治二年（1645年）闰六月，隆武帝在福建登基，也召其相助，主要负责联络澳门事宜。
南明最后一任皇帝永历帝朱由榔与天主教的渊源最为深远，虽然他接触天主教的时间并没有他的两位前任早，但是他受到的影响却作为深远。
