因此，"土木堡之变"前后的瓦剌虽然极度强大，但内部却存在着各种各样的矛盾。
1、瓦剌与蒙古各部的矛盾。瓦剌虽然通过武力征服和强行联姻的方式，一定程度解决了统治蒙古各部的问题，但由于瓦剌崛起时间太短，再加上蒙古草原部落联盟式的统治方式，蒙古各部真心臣服瓦剌者，其实极为有限。这便导致瓦剌虽然统治范围极广，但其实真正能够调用的力量极为有限。事实上，就在也先被杀之后，瓦剌便丧失了对蒙古各部的统治。
2、瓦剌内部同样存在矛盾。在瓦剌内部，脱脱不花虽然被奉为了可汗，但大权却全部操持于太师也先手中，这使得两人之间的矛盾极深。而在北京保卫战之后，随着也先的战败，脱脱不花更是单独向明朝遣使进贡，与明廷议和，而此后双方矛盾不断加深，更是发生了一场火并，也先之后则是杀死脱脱不花自立为汗，然而也先也在随后的政变中被杀。
如上所述，此时的瓦剌虽然极为强大，但其实也先本人所能调用的力量其实极为有限，北京保卫战时他所率领的主力也不过三万人而已，面对明朝迅速集结的二十余万大军，也先就算想有所作为，也是极为困难。
